La Vigilancia e Inteligencia Estratégica consisten en un modo de gestión para conseguir, de forma temprana, la información necesaria que permita a las instituciones tomar las mejores decisiones mediante un análisis objetivo y crítico de la situación en la cual se encuentran los procesos de innovación, desarrollo e investigación en cuanto a su eficiencia y su calidad. Se presenta el resultado del análisis documental de las políticas de Ciencia, Tecnología e Innovación, los criterios de evaluación e indicadores que permiten el diseño y aplicación de la “Metodología de Autoevaluación de la Innovación, desarrollo e Investigación en las Entidades de Ciencia, Tecnología e Innovación del Ministerio de Educación Superior de la República de Cuba, para ello se utilizaron los métodos planteados por la Vigilancia y la Inteligencia estratégica recogidos en la norma UNE 166006 del 2018, en el cual se obtuvo una recopilación de información de los principales Manuales de ciencia, tecnología e innovación para crear la Guía de Auto Evaluación aplicada en la Metodología. -- Los autores